- Wydział Chemii
- Wydział Farmaceutyczny (Collegium Medicum w Bydgoszczy)
- Wydział Filozofii i Nauk Społecznych
- Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej
- Wydział Humanistyczny
- Wydział Lekarski (Collegium Medicum w Bydgoszczy)
- Wydział Matematyki i Informatyki
- Wydział Nauk Biologicznych i Weterynaryjnych
- Wydział Nauk Ekonomicznych
i Zarządzania - Wydział Nauk Historycznych
- Wydział Nauk o Polityce i Bezpieczeństwie
- Wydział Nauk o Zdrowiu (Collegium Medicum w Bydgoszczy)
- Wydział Nauk o Ziemi i Gospodarki Przestrzennej
- Wydział Prawa
i Administracji - Wydział Sztuk Pięknych
- Wydział Teologiczny
